药学部是集药品供应管理、药学服务、教学科研为一体的综合部门；现有药学技术人员34人，其中高级职称3人，硕士研究生及以上学历6人。科室下设立门诊药房、住院部药房、中药房、眼科药房、药品库房、临床药学室、基因检测室、血药浓度检测室等。

业务范围：科室负责一院三区的药品供应保障，确保药品质量与安全；目前配备临床药师共12名，覆盖抗感染、心血管内科、肠外肠内营养、抗肿瘤药物、疼痛药物治疗、妇产科、小儿用药、肾内科、中医肺病等多个亚专业；取得重庆市临床药师规范化培训师资1名；参与多学科会诊（MDT）、提供个体化用药方案、不良反应监测及用药教育；开展基因检测、血药浓度监测指导个体化精准用药指导；开设专科药学咨询门诊（PCCM咳喘门诊、心衰医药联合门诊），为患者提供用药评估与指导；逐步从传统的“以药品调配为中心”向“以病人为中心”新的药学管理模式转变，持续提升临床合理用药水平，保障患者用药安全。